二氧化碳培養箱大致可以分為兩類：水和空氣套式的培養箱。我們來看看每種方法的優點和缺點。
 
水夾套培養箱
水夾套培養箱依靠培養箱壁內的熱水提供整個培養箱的均勻溫度。由于水的高熱容量，它們能夠長時間保持所需的溫度，這對于多個門開啟或停電是有利的。
 
灌裝和加熱培養箱需要一定的時間，因此水套培養需要很長的時間。一旦填滿，它很沉重，很難移動。此外，停滯的溫水是污染物生長的理想場所。這可以通過在襯里和HEPA過濾中使用銅來限制，但仍然是水夾套培養箱的風險。
 
空氣夾套培養箱
由于培養箱壁充滿空氣而不是水，因此空氣夾套培養箱更輕更快。他們迅速達到理想的溫度并且維護工作量少得多。它們也適用于高溫滅菌，可以達到180°C以上的溫度，使用水套式時不可能達到。
 
如果受污染，空氣夾套培養箱可通過高熱或過氧化氫處理等方式快速凈化。然而，它們對溫度變化更敏感，因為空氣的熱容量小于水。如果頻繁開門或停電，這可能會造成問題。
 
溫度均勻性也可能是一個問題，造成冷點。但是，這個問題在很大程度上已經解決了，但是建議在購買前詢問空氣流量和溫度的均勻性。空氣夾套培養箱也可能更容易形成冷凝水，盡管通過使用防凝結技術可以大大減少這種情況。